عنوان مقاله :
بررسي بيوانفورماتيكي اثر miRNAs بر بيان ژنهاي دخيل در فرآيند نورونزايي در مغز ماهي گورخري (Danio rerio)
پديد آورندگان :
بنايي ، مهدي دانشگاه صنعتي خاتم الانبياء (ص) بهبهان - دانشكده منابع طبيعي و محيط زيست - گروه شيلات , سگوند ، شيوا دانشگاه صنعتي خاتم الانبياء (ص) بهبهان - دانشكده منابع طبيعي و محيط زيست - گروه شيلات
كليدواژه :
miRNAs , Target Scan , Diana , ماهي گورخري , نورونزايي
چكيده فارسي :
microRNAهاي (miRNA) مختلفي در فرآيند تمايز سلول هاي عصبي و نورون زايي در مغز مهره داران نقش دارند، اما بررسي هاي انجام شده بر miRNAهاي در ماهيان و تعيين ژن هاي هدف آنها بسيار محدود است. ريزآرايه به عنوان يك روش استاندارد براي مطالعه كلي ژن هاي تحت كنترل miRNAها است. اما هزينه بسيار زياد اين روش، استفاده از آن را در بسياري از مواقع محدود كرده است. اين در حالي است كه با پيشرفت الگوريتم بيوانفورماتيكي و مدل سازي كامپيوتري مي توان اهداف mRNA را براي miRNA پيش بيني كرد. از اين رو، در مطالعه حاضر تلاش شده است تا از طريق بررسي بيوانفورماتيك ژن ها و miRNAهاي دخيل در تنظيم ژن هاي فعال در تمايز سلول هاي عصبي و نورون زايي در مغز ماهي گورخري، با استفاده از نرم افزارهاي پايگاه هاي Target Scan و DIANA ژن ها و miRNAهاي مربوطه شناسايي شود. نتايج بررسي هاي بيوانفورماتيكي انجام شده نشان داد كه بيان ژن هاي neurod6b، neurod2، neurod4، olfm1a و olfm1b، gle1، sox11a و sox11b، cadm1b، notch2 و notch1b با بيشترين احتمال ممكن است در مسير نورونزايي تحت تاثير dremiRNAs قرار گيرند. از اين رو به نظر مي رسد كه محصول اين ژن ها مي تواند به عنوان كانديداي مناسب جديدي براي بررسي هاي تجربي شناخت مسير نورون زايي در مغز ماهي گورخري در نظر گرفته شود.
عنوان نشريه :
فيزيولوژي و بيوتكنولوژي آبزيان