غربالگري بيوانفورماتيكي مهاركننده‌(هاي) پروتئاز NS3/4A ويروس هپاتيت سي از دو گياه دارويي Cornus officinalis و Syzygium aromaticum

زمينه و هدف: عفونت ناشي از ويروس هپاتيت سي يكي از معضلات مهم پيش روي سلامت عمومي ويكي از عوامل اصلي مرگ و مير در جهان است. بنابراين اخيرا پژوهش هاي زيادي با هدف معرفي تركيبات جديد و موثر ضد هپاتيت سي بويژه تركيبات گياهي انجام شده است. هدف از پژوهش حاضر غربالگري بيوانفورماتيكي مهاركننده (هاي) پروتئاز ويروس هپاتيت سي از دو گياه دارويي Cornus officinalis و Syzygium aromaticum مي باشد. روش كار: ابتدا ساختار سه بعدي پروتئاز ويروس هپاتيت سي و تركيبات غالب گياهان مذكور به ترتيب از پايگاه داده هاي پروتئين وPubchem دريافت شد. سپس خصوصيات فيزيكوشيميايي تركيبات گياهي و پتانسيل سميت سلولي و جهش زايي آن ها با استفاده از نرم افزارهايSwiss ADME و Toxtree پيش بيني شد. در نهايت تركيبات گياهي و پروتئاز هپاتيت سي در بررسي داكينگ مولكولي با استفاده از نرم افزار iGemdock 2.1 مورد مطالعه قرار گرفتند. يافته ها: نتايج نشان داد كه تركيبات مورد بررسي فاقد پتانسيل جهش زايي و سميت سلولي هستند. نتايج بدست آمده حاكي از برهمكنش هاي قوي و مناسب تركيبات مورد مطالعه با آنزيم NS3/4A خصوصا در ناحيه ي مسئول فعاليت پروتئازي است. افزون بر اين مشخص شد كه 1,2,6Trigalloylglucose،Hyperoside، Isoquercitrin، Rhamnetin، Ursolic acid و Methyl salicylate برهمكنش هاي قوي تري را با اسيدآمينه هاي كليدي جايگاه فعال آنزيم ايجاد مي كنند. نتيجه گيري: بر اساس نتايج حاصل شده مي توان نتيجه گرفت كه تركيبات گياهي مورد بررسي مي توانند به عنوان نامزد هاي مناسبي جهت بررسي هاي برون و درون تني به منظور دستيابي به تركيبات ضد هپاتيت سي مورد ارزيابي قرار گيرند.