ارتباط ميان استعداد ابتلا به سرطان معده و برخي واريانت‫ هاي تك‫نوكلئوتيدي ميكروRNAها در جمعيت عمومي استان اردبيل

The Relationship between Gastric Carcinogenesis Susceptibility and Some SNPs in MicroRNA Genes in General Population of Ardabil Province

زمينه و هدف: سرطان معده چهارمين سرطان شايع در جهان بوده و استان اردبيل از نظر شيوع سرطان معده در رده ‫هاي بالاي جهاني قرار دارد. ميكروRNAها ملكول‫ هاي RNA غير كد كننده با طول 18 تا 21 نوكلئوتيد بوده و به علت دارا بودن نقش تنظيمي در سطوح پس از بيان ژني، دچار تغييرات عملكردي ناشي از تغييرات تك نوكلئوتيدي مي‫ گردند. تغييرات تواليايي ژني miRNAها مي‫تواند منجر به اعطاي استعداد سرطانزايي گردد. روش كار: پس از استخراج DNA ژنومي از لكوسيت هاي خون محيطي 150 فرد سالم، ساكن و متولد استان اردبيل، وجود 30 واريانت تك نوكلئوتيدي مستعدكننده به سرطان در ژن‫هاي miRNAها با روشWhole Exome Sequencing (WES) مورد بررسي قرار گرفت. نتايج بدست آمده توسط روش Sanger-based PCR-Sequencing مورد ارزيابي قرار گرفتند. روش آماري همبستگي پيرسون جهت بررسي اختلاف آماري فراواني جمعيتي استفاده گرديد. يافته­ ها: پس از تاييد نتايج WES، مقايسه فراواني جمعيتي واريانت هاي منتخب با جمعيت هاي عمومي ايران، اروپا و جهان انجام و بر اساس نرخ استاندارد شده بر اساس سن (ASR)، شش واريانت واجد اختلاف معني دار شامل rs10061133، rs12220909، rs12983273، rs2292832، rs2505901 و rs6505162 مشاهده گرديدند. نتيجه­ گيري: با توجه به وجود گزارشات متعدد مبني بر ارتباط ميان واريانت‫ هاي rs10061133، rs12220909، rs12983273، rs2292832، rs2505901 و rs6505162 با سرطان معده درمطالعات مورد- شاهدي در نقاط مختلف جهان و جمعيت‫ هاي متفاوت، اختلاف آماري بدست آمده مي‫ تواند بيانگر وجود استعداد ژنومي جمعيت استان اردبيل براي ابتلا به سرطان معده باشد.

Background & Objectives: Gastric cancer is the fourth most common cancer in the world and Ardabil province is in the top ranks in the world. MicroRNAs are non-coding RNA molecules with a length of 18 to 21 nucleotides and due to their regulatory role in post- transcriptional gene expression; single nucleotide polymorphisms (SNPs) could affect their function on target genes regulation. Methods: Genomic DNA was extracted from peripheral blood of 150 healthy volunteers, which were born and living in Ardabil province, 30 SNPs in microRNA genes have been detected by the Whole Exome Sequencing assay. Then, the obtained results were evaluated using Sanger-based PCR-Sequencing method. The Pearson correlation test was used for finding significant relationships. Results: After confirming the WES results, the population frequency of the selected variants was compared with the general populations of Iran, Europe and the world. Based on the agestandardized rate (ASR), six variants with significant differences, including rs10061133, rs12220909, rs12983273, rs2292832, rs2505901 and rs6505162 were observed. Conclusion: According to the previous case-control studies which indicate the association between the variants rs10061133, rs12220909, rs12983273, rs2505901, and rs6505162 and gastric carcinogenesis in various populations, the observed significant differences in our population could imply on the presence of the cancer susceptibility in Ardabil province.