روابط تكاملي ساختار دمين پروتئين ATAXIN-2 در گياهان: بينش احتمالي دخالت اين پروتئين در بومي‌سازي ترجمه در فرايند جنين‌زايي گياه برنج (Oryza sativa)

با توسعه فن آوري‌هاي تعيين توالي با توان بالا، داده‌هاي توالي با سرعت زيادي جمع‌آوري مي‌شوند و تفسير عملكرد آنها يك چالش اساسي است. ژنATXN2 كد كننده پروتئيني با عملكرد ناشناخته در برنج (oryza sativa) است. هدف از اين مطالعه، تعيين ساختار دمين و پيش‌بيني عملكرد اين پروتئين بود. از اين رو درخت فيلوژني موتيف توالي با 164 توالي اسيد آمينه ATAXIN-2 از 45 گونه گياهي توسط مجموعه MEME و نرم افزار Phylip آناليز شد. نتايج، دو نوع كلي كلاس از پروتئين‌هاي ATAXIN-2 را مشخص نمود. عدم وجود دمين LsmAD در يك كلاس ممكن است ويژگي‌هاي عملكردي متمايزي را نسبت به كلاس ديگر ATAXIN-2 اعطا كند. در اين پژوهش عملكرد ATAXIN-2 به عنوان پروتئين‌هاي متصل شونده به RNA (RNA binding) پيش‌بيني شد كه در تنظيم mRNA سيتوپلاسمي در جنين‌زايي برنج نقش دارد. يافته‌هاي اين پژوهش مي‌تواند اساس تحقيق در مورد عملكرد اين پروتئين در هدف قرار دادن زيرمجموعه‌هاي جداگانه mRNA به مكان‌هاي زير سلول در گياهان باشد كه توسط سلول‌هاي دو قطبي جنين براي ايجاد محفظه‌هاي عملكردي مشخص بكار گرفته مي‌شود.