بررسي بيوانفورماتيكي تغييرات بيان رونوشت ژن‌هاي شيردان به آلودگي انگل Heamonchus contortus در گوسفندان مقاوم و حساس

هدف از اين مطالعه، انجام يك بررسي سيستماتيك و متاآناليز داده هاي جمع آوري شده از گوسفندان آلوده شده با Heamonchus contortus به عنوان يكي از مهمترين و بيماري زاترين انگل هاي دستگاه گوارش گوسفند و تجزيه و تحليل كلي تغيير در رونوشت ژن هاي شيردان در پاسخ به اين عفونت با استفاده از فناوري RNA-seq و ابزارهاي بيوانفورماتيك بود. به منظور شناسايي ژن‌ها و مسيرهاي مرتبط با عفونت، متاآناليز با تركيب مجموعه داده هاي مختلف عفونت Heamonchus contortus گوسفند با استفاده از بسته رنك پراد نرم افزار R انجام شد و نتايج به دست آمده براي استحصال اطلاعات بيشتر مورد تجزيه و تحليل هاي پائين دستي قرار گرفتند. نتايج حاصل از متاآناليز نشان داد كه در مجموع، 1388 ژن بين نژادهاي مقاوم و حساس داراي بيان افتراقي DEGها بودند. مطابق با نتايج حاصل از تجزيه و تحليل هستي شناسي ژن و دانشنامه كيوتوي ژن ها و ژنوم ها KEGG ، اين ژن هاي داراي بيان افتراقي DEGها در فرآيندهاي زيستي متعددي مانند سوخت و ساز واحدهاي يك كربني، ترجمه، مسير سيگنالينگ رسپتور سطح سلولي، پاسخ ايمني، مسيرهاي متابوليكي و ... درگير بودند. با استفاده از تجزيه و تحليل برهمكنش پروتئين-پروتئين، ژن هاي هاب متعددي مانند آلبومين و CD4 شناسايي شدند كه ممكن است نشان دهد بهبود پاسخ ايمني ناشي از افزايش بيان ژن هاي مختلف در ايجاد مقاومت تأثير مي گذارد. نتايج اين مطالعه، بينشي كلي از تغييرات در ترانسكريپتوم نژادهاي مقاوم و حساس گوسفند و ساز و كارهاي مولكولي مقاومت ميزبان در نتيجه عفونت Heamonchus contortus ارائه مي دهد كه مي تواند مبنايي براي تحقيقات بيشتر در مورد اين موضوع فراهم نمايد.