تجزيه و تحليل اثرات تنظيمي lncRNAها بر بافت كليه در جوجه‌هاي گوشتي مبتلا به سندروم آسيت

آسيت يك اختلال متابوليكي مهم در صنعت طيور تجاري مي باشد كه بافت هاي متفاوتي از جمله كليه را درگير مي كند. در اين پژوهش، ژن هاي غيررمزكننده بلند(lncRNA) مؤثر در بيماري آسيت در جوجه‌هاي گوشتي كه اثر تنظيمي روي ژن‌هاي mRNA هدف دارند با استفاده از فناوري RNA-seq مورد بررسي قرار گرفت. در روز 39 آزمايش، از بافت كليه، چهار نمونه سالم و چهار نمونه بيمار RNAكل استخراج و با استفاده از پلتفرم illumina Hiseq2500 توالي‌يابي انجام شد. بر اساس نتايج آناليز RNA-seq، تعداد 1421 رونوشت lncRNA از 921 جايگاه ژني شناسايي شد كه با 154 ژن رمزشونده در محدوده 100 هزار باز بالادست و پايين‌دست ژن‌‌هاي مورد نظر ارتباط داشتند. از ميان جفت ژن‌‌هاي رمزشونده و lncRNA، آن‌هايي كه همبستگي بياني بيشتر از مثبت 90 درصد و كمتر از منفي 90 درصد داشتند، به‌ترتيب به‌عنوان جفت ژن‌‌‌‌هاي با بيان هم‌راستا و غير هم‌راستا مورد ارزيابي قرار گرفتند. بررسي عملكردي اين ژن ها نشان داد كه 13 ژن به‌طور معني داري در مسيرهاي متعدد زيستي مرتبط با بيماري مشاهده شدند. با هدف قراردادن مسيرهاي مهم زيستي به‌دست آمده و ژن هاي مؤثر بر آن ها شامل C1GALT1C1، PLCD4، GCNT4، DGKA، IMPA2، GBA2، CERS5، CDH1، CSF1، CTNND1، LPAR2، DAO، PIPOX و تمركز بر نقش آن‌ها در پيشگيري و درمان بيماري آسيت، درك بهتري از عملكرد آن‌ها را در تأمين انرژي و حفظ هموستاز كليه، ممكن ساخته تا جهت پيشگيري و درمان بيماري آسيت، بينشي جديد براي اصلاح نژاد و كاهش مشكلات مربوط به اين بيماري در گله‌هاي تجاري ارائه دهد.