عنوان مقاله :
داكينگ مولكولي تركيبات زيستي گياه آويشن باغي (L. Thymus vulgaris) با آسپارتيل پروتئاز ترشحي‌ـ5 مخمر Candida albicans براي يافتن تركيبات مهاري احتمالي
پديد آورندگان :
زارع ، ميلاد دانشگاه مراغه , رزم آرا ، جعفر دانشگاه تبريز - گروه علوم كامپيوتر , پرويزپور ، سپيده دانشگاه علوم پزشكي تبريز - مركز تحقيقات نانوتكنولوژي دارويي , برزگري ، امير عباس دانشگاه مراغه - گروه زيست‌شناسي
كليدواژه :
گياه آويشن باغي , كانديدا آلبيكنس , فارماكوكينتيك , داكينگ مولكولي
چكيده فارسي :
زمينه و هدف: كانديدا آلبيكنس علي‌رغم اين كه به عنوان يك مخمر همسفره با انسان در نظر گرفته مي‌شود، در شرايط خاص مي‌تواند به يك عامل مهاجم تبديل شده و باعث انواع مختلفي از عفونت‌هاي حاد يا مزمن شود. استفاده از داروهاي ضد قارچي موجود عليه اين مخمر، به دليل اثرات جانبي اين داروها و نيز مقاومت اين مخمر نسبت به آنها با محدوديت همراه است. بنابراين، هدف از اين مطالعه تعيين و بررسي داكينگ مولكولي تركيبات زيستي گياه آويشن باغي (L. Thymus vulgaris) با آسپارتيل پروتئاز ترشحي‌ـ5 مخمر Candida albicans براي يافتن تركيبات مهاري احتمالي بود.روش بررسي: در اين مطالعه داكينگ مولكولي كه در سال 1403انجام شد، مواد مؤثره گياهي آويشن باغي از پايگاه داده LOTUS و NPASS به دست آمد و ساختار پروتئين SAP5 با جستجو در بانك داده RCSB PDB جمع‌ّوري شد. داكينگ مولكولي ليگاندها با آنزيم SAP5 با استفاده از نرم‌افزار AutoDock Vina در بسته نرم افزاري PyRx 0.8 براي محاسبه انرژي اتصال و تعيين موقعيت اتصال هر تركيب در برهمكنش با SAP5 استفاده شد. تركيباتي كه بهترين انرژي اتصال را با پروتئين هدف داشتند، از نظر خصوصيات فارماكوكينتيك و سميت مورد بررسي قرار گرفتند و در انتها ليگاندهاي منتخب با استفاده از BIOVIA Discovery Studio تصويرسازي شدند. داده‌هاي جمع‌آوري شده با استفاده از نرم‌افزارهاي مختلف و مقايسه با نتايج مقالات قبل در اين زمينه تجزيه و تحليل شدند.يافته‌ها: انرژي اتصال تركيبات گياه آويش به جايگاه فعال آنزيم SAP5 از 9.9- تا 3.4- متغير بود. بيشترين تمايل اتصال به جايگاه فعال اين آنزيم مربوط به سه تركيب Eriodictin، (-)-Taxifolin و Ellagic Acidبود. اين تركيبات از نظر ويژگي‌هاي فارماكوكينتيك و سميت مطلوب بودند. پژوهش‌هاي فارماكوكينتيك سه تركيب منتخب با استفاده از سرور آنلاين SwissADME نشاند دهنده خواص دارويي اميدوار كننده اين تركيبات بود. با وجود اين، بررسي سميت اين تركيبات با استفاده از سرورهاي ADMETlab و ProTox-II نشان دهنده سميت اريوديكتين بود. نتيجه‌گيري: نتايج پژوهش‌هاي داكينگ نشان داد كه برخي تركيبات موجود در گياه آويشن توانايي مهار آسپارتيل پروتئاز ترشحي-5 را دارند. بنابر اين، احتمالاً يكي از مكانيسم‌هاي دخيل در اثرات ضد گانديدايي آويشن باغي بر مخمر كانديدا آلبيكنز از طريق مهار اين پروتئين مي‌باشد.
عنوان نشريه :
ارمغان دانش
عنوان نشريه :
ارمغان دانش
