طراحي مجازي و مدلسازي مولكولي تركيبات پپتيدي پايدار كننده ساختار چهارتايي گوانين

مدلسازي مولكولي نقش بسيار مهمي در كشف و توسعه داروهاي جديد دارد. روش‌هاي مجازي در كشف داروهاي جديد هزينه‌ توليد را بسيار كاهش مي‌دهند. مدلسازي مولكولي در توسعه داروهاي ضدسرطان جايگاه خاصي دارد. ساختار چهارتايي گوانين يك ساختار ثانويه يكتا است كه در برخي از توالي‌هاي غني از گوانين تشكيل مي‌گردد. ساختار چهارتايي گوانين در فعال‌كننده آنكوژن‌ها تشكيل شده و مانع بيان آنها مي‌شود. بنابراين تركيبات پايدار كننده چهارتايي گوانين به عنوان هدف درماني در سرطان شناخته مي‌شوند. در اين مطالعه به بررسي برهم‌كنش پپتيد DSM و همچنين طراحي و مدلسازي پپتيدهاي پايدار كننده ساختار چهارتايي گوانين پرداخته شده است. براساس نتايج بدست آمده، مهمترين پارامتر در اتصال به ساختار چهارتايي گوانين وجود دو گروه بازي در زنجيره پپتيدي است. در بهترين زنجيره‌هاي بدست آمده (KGREIGYAK و KGREIGMYAK) آمينو اسيدهاي ليزين و آرژنين در فاصله مناسب از يكديگر قرار گرفته‌اند و پتانسيل بالايي براي اتصال به چهارتايي گوانين دارند. اين آمينو اسيدهاي بازي با گروه‌هاي فسفات زنجيره DNA پيوندهاي يوني تشكيل مي‌دهند. آمينو اسيد تايروزين با حلقه گوانين برهم‌كنش‌هاي π-π دارد.