عنوان مقاله :
تنوع باكتري هاي ريزوبيومي جدا شده از گرههاي ريبوزومي ريشه گياه يونجه آلفا آلفا (Medicago sativa) با استفاده از قطعات برشي ژن 16rRNA
پديد آورندگان :
گلابكش ، شهرزاد دانشگاه آزاد اسلامي واحد دماوند - دانشكده فني - گروه محيط زيست , خرم نژاديان ، شهرزاد دانشگاه آزاد اسلامي واحد دماوند - دانشكده فني - گروه محيط زيست , رجب زاده قطرمي ، ابراهيم دانشگاه آزاد اسلامي واحد دماوند - دانشكده فني - گروه محيط زيست , رشنو ، محمد دانشگاه آزاد اسلامي واحد دماوند - دانشكده فني - گروه محيط زيست
كليدواژه :
تنوع , باكتري ريزوبيومي , كرهك , يونجه , ژن 16rRNA
چكيده فارسي :
گياه يونجه آلفا آلفا (Medicago sativa)، از منطقه پشمينهزار انديمشك و در فصل بهار سال 1398 جمع آوري شد. پس از كشت همسانههاي هر جدايه روي محيط آگار مغذي، ويژگيهاي ميكروسكپي بررسي شد. جهت بيان ژن 16S rDNA ، باكتريهاي ايزوله شده در محيط YMA در شرايط هوازي و در دماي 25-28 درجهي سانتيگراد كشت داده شدند. پرايمرهاي عمومي و كامل باكتري سينوريزوبيوم بر اساس ژن 16s rRNA gene sequences از سايت NCBI استخراج و در توالي يابي ژنهاي باكتريهاي جداسازي شده در اين مطالعه مورد استفاده قرار گرفتند. ترادفهاي بدست آمده با استفاده از نرم افزار Chromas Pro ويرايش و با استفاده از نرم افزار بلاست در پايگاه دادههاي NCBI مورد تجزيه و تحليل و مقايسه قرار گرفتند. سه سويه از ريزوسفر گياه يونجهي آلفا آلفا (Medicago sativa) جداسازي و شناسايي شد. در بررسي ميكروسكوپي و ماكروسكوپي 3 سويه باكتري شناسايي شد. باكتري شماره 1 شناسايي شده گرم منفي و با ايجاد كلنيهاي كرم رنگ و برجسته، دومين باكتري گرم منفي و داراي كلنيهاي قرمز رنگ و كلني باكتري سوم جداشده از گياه جنس يونجه آلفا آلفا (Medicago sativa) صورتي بود. نتايج توالييابي 16S rRNA سويه جدا شده از ريزوسفر گياه يونجه را گونه (Sequence ID= CP 021215.1) Sinorhizobium meliloti (باكتري1)(درصد همپوشاني 97 و گپ هاي بازي ۲ درصد)، باكتري دوم Sequence ID= CP-000738.1)) Sinorhizobium medicae (باكتري 2)(درصد همپوشاني 97 و گپ هاي بازي ۲درصد) و باكتري سوم (Sequence ID= DQ-145546.1) Sinorhizobium meliloti (درصد همپوشاني 04/96 و گپ هاي بازي 4 درصد) شناسايي شد. با توجه به نقش تثبيت كنندگي اين باكتري هاي ريبوزومي، با تكثير اين گروه هاي باكتريايي و افزودن آنها به خاك مي توان، ضمن افزايش رشد گياهان زراعي، استفاده از كودهاي شيميايي را كاهش داد.
عنوان نشريه :
پژوهش هاي سلولي و مولكولي
عنوان نشريه :
پژوهش هاي سلولي و مولكولي