عنوان مقاله :
تمايز ارقام مقاوم ملون در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis بر اساس صفات ظاهري و الگوي حضور ژن‌هاي مقاومت
پديد آورندگان :
شكوهي فر ، فرهاد دانشگاه فردوسي مشهد - دانشكده كشاورزي - گروه گياه‌پزشكي , ممرآبادي ، مجتبي دانشگاه فردوسي مشهد - دانشكده كشاورزي - گروه گياه‌پزشكي , طوسي ، صهبا دانشگاه فردوسي مشهد - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي و به‌نژادي گياهان زراعي
كليدواژه :
بيماري پژمردگي فوزاريومي ملون , ژن‌هاي مقاومت حامل توالي‌هاي تكراري غني از لوسين , داده‌هاي ژنومي ملون , گزينش مبتني بر صفات مرتبط با مقاومت
چكيده فارسي :
دست‌يابي به نشانگرهاي مرتبط به صفت مقاومت به بيماري پژمردگي فوزاريومي ملون مي‌تواند در پيشبرد برنامه‌هاي اصلاحي مؤثر باشد. بدين منظور تعدادي از ارقام استاندارد ملون شامل ‘Charentais T’، ‘Charentais Fom1’، ‘Charentais Fom2’ و ‘BG-5384’ با سطوح مقاومتي مختلف در برابر قارچ Fusarium oxysporum f. sp. melonis، و يك رقم محلي به نام’خاتوني‘، از نظر صفات ظاهري گياه و همچنين الگوي حضور ژن‌هاي مقاومت در برابر بيماري‌ها مورد بررسي قرار گرفتند. بر اساس نتايج بدست آمده هر چند امكان تمايز ارقام بر اساس صفات ظاهري ممكن بود ولي از آنجا كه مطالعه اين صفات در ارزيابي تعداد زياد نمونه‌ها در مطالعات گزينشي كاري بسيار زمان‌بر و هزينه‌بر است، الگوي حضور ژن‌هاي مقاومت در داده‌هاي ژنومي اين ارقام مورد بررسي قرار گرفت. آناليزهاي داده‌هاي ژنومي ملون با هدف مكان‌يابي موقعيت گروه لينكاژي MRGH21 به‌عنوان يكي از گروه‌هاي لينكاژي حامل تعدادي از ژن‌هاي مقاومت انجام شد. توالي اين گروه لينكاژي از دو پايگاه بانك ژن در NCBI و پايگاه MELONOMICS رديابي شد و توالي حدفاصل دو ژن MRGH12 (MELO3C022143.2.1) و MRGH13 (MELO3C000335.2.1) در برگيرنده اين گروه لينكاژي روي كروموزوم شماره Ch09 استحصال شد. وجود جهش‌هاي نقطه‌اي متعدد در داده‌هاي ژنومي سبب شد تا توالي ژن MRGH13 جهت رديابي در ارقام ملون مورد بررسي قرار گيرد. آغازگرهاي اختصاصي PSh21-F/R براي رديابي بخشي از توالي اين ژن طراحي شد. نتايج رديابي نشان داد تك باند اختصاصي در ارقام ‘Charentais Fom1’ و ‘BG-5384’ منطبق با اندازه مورد انتظار قابل رديابي است. نقش احتمالي پروتئين كدشونده توسط ژن MRGH13 با آناليز توالي آن در ابزار تحت شبكه InterPro اين پروتئين را به‌عنوان يك عضو خانواده پروتئين‌هاي حامل توالي‌هاي تكراري غني از لوسين تاييد نمود و موقعيت دمين‌هاي TIR، NB-ARC و LRR را مشخص نمود. فرآيندهاي زيستي مرتبط با پروتئين MRGH13 در ابزار تحت شبكه QuickGO ارتباط آن را در مسير پيام‌رساني تنظيم‌كننده پاسخ‌هاي ايمني نشان داد. در مطالعات آتي ارزيابي قابليت تمايز ارقام مقاوم براساس ژن‌هاي مقاومت از جمله ژن MRGH13 در تعداد بيشتري از نمونه‌ها مورد بررسي پيشنهاد مي‌گردد. همچنين با توجه به كاركردهاي پيش‌بيني‌شده براي پروتئين MRGH13 بررسي نحوه برهمكنش آن با ديگر پروتئين‌هاي مقاومت و همچنين پروتئين‌هاي عوامل بيماري‌زا مي‌تواند در شناسايي نقش كاركردي آن در مقاومت مفيد باشد.
عنوان نشريه :
علوم باغباني
عنوان نشريه :
علوم باغباني
