مطالعه فارماكولوژي شبكه‌اي از مسيرهاي سيگنال ‌دهي و ژن‌ هاي هدف ماده بربرين در درمان سرطان تخمدان با استفاده از تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي

سرطان تخمدان يكي از بيماري‌ هاي كشنده در زنان مي‌باشد كه تشخيص زودهنگام آن مشكل است. بنابراين، نياز فوري به عوامل شيميايي وجود دارد كه مي‌تواند در كنترل توسعه سرطان تخمدان كمك كند. بربرين، به عنوان يك ماده شيميايي، داراي خواص آنتي اكسيداني و دارويي متعددي است و نقش ضد سرطاني اين ماده تحت پژوهش قرار دارد. هدف اين مطالعه تجزيه و تحليل ژن‌هاي هدف بربرين در سرطان تخمدان و شناخت مسيرهاي سيگنال‌دهي بربرين با استفاده از فارماكولوژي شبكه است. در اين مطالعه، مجموعه داده GSE36668 از پايگاه داده GEO گرفته شد. ژن‌هاي داراي بيان افتراقي(DEGs)، توسط GEO2R با 05/0 adj Pvalue و 2≤∣logFC∣ مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. اهداف مرتبط با بربرين از پايگاه‌هاي داده SwissTargetPrediction و Pharm Mapper جمع‌آوري شدند. شبكه برهمكنش پروتئين-پروتئين (PPI) اهداف مشترك بربرين و DEGs، بر اساس داده‌هاي موجود در پايگاه داده String و با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape ترسيم شد. ژن‌هاي مشترك در بربرين و سرطان تخمدان، در بررسي مسيرهاي زيستي (BP) و مولكولي (MF) و سلولي استفاده شدند. 10 ژن هاب انتخابي در اين مطالعه شامل ESR1، STAT1، CDK1، RXRA، PIK3CA، PGR، CCNB1، CHEK1، PIK3R1 و PIK3CG بودند. همچنين مشخص شد ژنهاي هدف بربرين مي‌توانند در مسيرهاي سيگنال‌دهي سرطان، سرطان زايي شيميايي، تنش برشي سيال و آترواسكلروز، بلوغ تخمك با واسطه پروژسترون و مسير سيگنالينگ PPAR، نقش داشته باشند. بر اساس اين يافته‌ها بربرين مي‌تواند بر بيان ژن‌هاي موثر در سرطان تخمدان و محصولات پروتئيني آن‌ها اثر داشته و با اثر بر مسيرهاي زيستي دخيل در اين بيماري، راهكار مناسبي براي درمان سرطان تخمدان باشد.