پويش ژنوم برخي صفات توليدمثلي گاو هلشتاين ايران

هدف از انجام اين تحقيق شناسايي نشانگرهاي تك نوكلئوتيدي موثر بر برخي صفات توليدمثلي در گاوهاي شيري هلشتاين ابران است. براي اين منظور از نمونه مو 150 راس گاو كه بين سال هاي 1390 1392 در يكي از گاوداري هاي شركت فردوس پارس متولد شده بودند، جهت تعيين ژنوتيپ با تراشه حاوي SNP 30108 استفاده شد. بعد از انجام مراحل كنترل كيفيت  داده ها با استفاده از روش تجزيه واريانس حداقل مربعات با استفاده از رويه GLM، آناليز GWAS انجام گرديد. نتايج آناليز نشان داد 2 تغيير تك نوكلئوتيدي با صفت فاصله زايش تا  آبستني و 12 تغيير تك نوكلئوتيدي با صفت فاصله بين اولين و آخرين تلقيح ارتباط معني داري (pValue 0.04) داشتند، در صفت روزهاي باز  11 و براي صفت تعداد تلقيح به ازاي آبستني نيز 5 تغيير تك نوكلئوتيدي معني دار (pValue 0.04) وجود داشت. بررسي ها بعد از مكان يابي ژنها  تعداديQTL و ژن هاي مختلفي را  شناسايي كرد كه بر صفات مورد بررسي اثرگذار يا كنترل كننده بودند. از جمله اين ژن ها مي توان به ژن NUF2  در كروموزوم 3 كه بر تكامل سلول تخم، ژن ANAPC1  در كروموزوم 11 كه بر جنباني اسپرم، ژن PITX2  در كروموزوم 6 كه بر توليد شير، ژن ELOVL6 در كروموزوم 6 كه بر افزايش وزن بدن، موثر است اشاره نمود. به طور كلي مي توان نتيجه گرفت كه كروموزوم 3، 6 و 11 داراي تغييرات تك نوكلئوتيدي هستند كه در ارتباط قوي تري با صفات توليدمثلي بوده و در حاشيه همين تغييرات تك نوكلئوتيدي، QTL و ژن هايي يافت شد كه مرتبط با صفات توليد مثلي بوده اند.