بررسي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ‌هاي انار از هفت منطقه ايران با استفاده از نشانگر AFLP

Assessment of Genetic Variation of Punica granatum L. Genotypes from Seven Regions of Iran Using AFLP Markers

انار يكي از مهمترين گياهان بومي و تجاري-باغباني در مناطق بياباني و نيمه بياباني ايران محسوب مي‌شود. از طرف ديگربه علت تاريخچه طولاني كشت انار در ايران، ژنوتيپ‌ها از مناطق مختلف با تشابه‌هاي آشكار ولي با نام‌هاي متفاوت كشت شده‌اند. بنابراين براي مديريت كارآمد و برنامه‌هاي اصلاحي آينده، تشخيص دقيق ژنوتيپ‌ها مورد نياز است. در اين پروژه DNA ژنومي 31 ژنوتيپ مختلف انار متعلق به هفت استان ايران، توسط نشانگر مولكولي AFLP، با استفاده از هفت تركيب آغازگري (EcoRI/MseI) مورد بررسي قرار گرفت. نتايج حاصل از تجزيه خوشه‌اي حاكي از وجود شباهت بسيار بالا بين ژنوتيپ‌ها مورد مطالعه بود. همچنين، گروه‌بندي به دست آمده در بسياري از مواقع با صفات مورفولوژيك موجود مطابقت نداشت. نتايج به دست آمده نشان داد كه ژنوتيپ‌ها عموماً مستقل از خاستگاه جغرافيايي و نامگذاريشان گروه‌بندي شده‌اند. شاخص تنوع h، تجزيه و تحليل هماهنگ اصلي (PCoA)، شاخص Gst و تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA)، همگي حاكي از شباهت قابل توجه بين ژنوتيپ‌هاي مورد بررسي و ميزان نسبتاً پايين تنوع در داخل ژنوتيپ‌هاي هر منطقه بود. تنوع گسترده انار در ايران و سطح پايين چندشكلي بين اين ژنوتيپ‌ها، مي‌تواند مربوط به ازدياد رويشي و نوع گرده‌افشاني اين گياه باشد.

Pomegranate (Punica granatum L. that one Punicaceae) is one of the important economical and commercial horticultural plants cultivated in arid and semiarid parts of Iran. Also, due to the long history of pomegranate cultivation in Iran, genotypes from different regions with obvious similarities in appearance but with different names can be observed. Thus, the precise discrimination between .genotypes is essential for effective management for future pomegranate breeding programs. In this study, AFLP markers based on seven primer combinations (EcoRI/Tru1I) were used to evaluate genetic variation and Phylogenic relationship among 31 different .genotypes of native pomegranate belonging to seven of Iran provinces. According to the cluster analysis, a relatively low genetic diversity was observed across the .genotypes studied. Also, the results showed that the clustering of the cultivars didn’t concerne to morphological traits. The derived dendrogram proved that .genotypes are clustered independently from their geographical origin and their denomination. Heterozygosity index, Principal co-ordinates analysis (PCoA), Gst Index and analysis of molecular variance (AMOVA) revealed noticeable similarity among studied populations and observed variation within populations was very low and near zero. The high level of morphological traits diversity in Iranian pomegranate and low level of polymorphism in genome organization of these .genotypes determined by AFLP markers may be related to the somatic propagation and also type of pomegranate pollination.