چندشكلي اگزون 2 ژن MHC- DRB3 در بز سرخ جبال بارز

Polymorphism of the second exon of MHC-DRB3 gene in Jabal-Barez Red goat

بز سرخ جبال‌بارز با جمعيتي بالغ بر 450 هزار راس در منطقه جيرفت و كهنوج پرورش مي‌يابد و با توليد كرك، گوشت قرمز و محصولات لبني از منابع درآمد مهم عشاير و دامداران محسوب مي‌شود. در اين پژوهش كه به منظور بررسي چند شكلي ژن GOLA-DRB3 با استفاده از PCR-REFLP در اين دام‌ها صورت گرفت از 100 بز به صورت تصادفي و انفرادي خونگيري شد. سپس DNA نمونه‌هاي خون دام ها با استفاده از كيت استاندارد استخراج و تعيين كميت و كيفيت شد. ناحيه اگزون 2 جايگاه GOLA-DRB3 به طول bp285 با روش Heminested-PCR در دو مرحله تكثير و محصول PCR توسط آنزيم TaqI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الكتروفورز با ژل اكريل آميد10% يا ژل 2% و رنگ آميزي اتيديوم برومايد آشكار شد. نتايج هضم محصولات PCR با آنزيم TaqI شامل دو قطعه 163bp و bp 122 (الگوي هضمي T) يا قطعه هضم نشده bp 285 )الگوي هضمي T) بود. جمعيت از لحاظ ژن GOLA-DRB3انحراف از تعادل هاردي- واينبرگ نشان نداد (05/0P < ). شاخص شانون، شاخص نيي، هتروزايگوسيتي مشاهده شده و هتروزايگوسيتي مورد انتظار به ترتيب 69/0، 50/0، 52/0 و 50/0 محاسبه شد. نتايج نشان داد كه جمعيت مورد مطالعه تنوع ژنتيكي خوبي دارد و كارايي نشانگر GOLA-DRB3 جهت تعيين تنوع ژنتيكي خوب است. با استفاده از نتايج اين پژوهش و پژوهش هاي قبلي و با در دست داشتن ركوردها و اطلاعات كمي جايگاه در اين جمعيت، مي‌توان شناسايي و تعيين محل جايگاه‌هاي موثر بر صفات كمي را انجام داد.

More than 450000 Jabalbarez Red Goat are breeding in the cities of Jiroft and Kahnooj and produce cashmere, meat and dairy products. In this study which was carried out to analyse the polymorphism of GoLA-DRB3 gene in Jabalbarez Red goat using PCR-RELP, blood samples were randomly and individually taken from 100 goats. Then DNA was extracted from blood samples using DIAtom DNA prep Kit and its quantities and qualities were determined. Exon 2 of DRB 3.2 gene encompassing 285 bp amplified with heminested-PCR method in two rounds and PCR products were digested into fragments at 122bp and 163bp (T restriction pattern) or an undigested fragment at 285bp (t restriction patten). The Population was hardy-Weinberg equilibrium (P < 0.05). Shanon Index, Nei index, observed heterozygosity and expected heterozygosity were calculated 0.69, 0.50, 0.52 and 0.50 respectively. Results show that the studied population has good genetic diversity, and the efficiency of GOLA-DRB3 marker for determination of genetic diversity is good. By using the results of this study and previous studies and the application of quantitative records and information for locus of this population, loci affecting quantitative traits can be detected.