شماره ركورد :
815306
عنوان مقاله :
آغازگرهاي اختصاي مبتني بر واكنش زنجيره‌اي پليمراز براي رديابي Picoa lefebvrei در ريشه‌هاي Carex stenophylla
عنوان فرعي :
Specific PCR-primers for detection of Picoa lefebvrei desert truffle in Carex stenophylla roots
پديد آورندگان :
جمالي، صمد نويسنده استاديار قارچ‌شناسي بخش گياه‌پزشكي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه رازي، كرمانشاه، ايران (jamali454@yahoo.com) Jamali, Samad
اطلاعات موجودي :
دوفصلنامه سال 1394 شماره 50
رتبه نشريه :
علمي پژوهشي
تعداد صفحه :
2
از صفحه :
206
تا صفحه :
207
كليدواژه :
ندارد
چكيده فارسي :
گونه‌هاي Picoa، آرايه‌هاي آسكوميست زيرزميني مي‌باشند كه در نواحي نيمه‌خشك شمال آفريقا، غرب آسيا، جنوب اروپا و كشورهاي خاورميانه از جمله ايران يافت مي‌شود. گونه‌هاي اين جنس با ريشه گياهان علفي يك‌ساله و چند‌ساله از جنس Helianthemum شامل: H. ledifolium،H. salicifolium var. salicifolium ، H. nummularium و H. squamatum تشكيل قارچ-ريشه مي‌دهند. در ايران، رابطه قارچ-ريشه بين دنبل‌هاي بياباني و گياهان تيره جگنيان به طور كامل بررسي نشده است. در اين مطالعه، ريشه‌هاي Wahlenb Carex stenophylla از مراتع مختلف جمع‌آوري شد كه بررسي‌هاي مزرعه‌اي و آناتوميكي رابطه قارچ-ريشه خارجي اين گونه گياهي با دنبل بياباني P. lefebvrei را مشخص كرد. ميسليوم‌هاي خارجي در اطراف تمام ريشه‌هاي تشكيل دهنده قارچ-ريشه مشاهده شدند. نواحي يگانه توالي‌هاي جداكننده نسخه‌برداري شده داخلي 1، 2 و ژن 8/5 اس دي. ان. اي. ريبوزومي گونه قارچي در ريشه گياهان با روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز تو در تو و استفاده از آغازگرهاي عمومي ITS1/ITS4 و آغازگرهاي اختصاصي طراحي شدهFLE 5´GTA CCT TAC CTG TTG CTT CCG TG ,) (RLE 5´ATC CCT ACC TGA GCC GAG GTC AA تكثير شد. با استفاده از اين روش، محصولي به اندازه 500 جفت باز از ريشه گياهان همزيست به دست آمد كه با نمونه‌هاي P. lefebvrei ثبت شده در بانك ژن صد در صد شباهت داشتند. اين موضوع ثابت كرد كه محصول واكنش زنجيره‌اي پليمراز تكثير شده با آغازگرهاي اختصاصي، متعلق به گونه P. lefebvrei بوده و به اين ترتيب ارتباط ميكوريزي اين گونه قارچي با گونه گياهي C. stenophylla به اثبات رسيد.
چكيده لاتين :
Picoa species are hypogeous desert truffles, which can be found in semi-arid ranges of North Africa, West Asian, South of Europe and Middle East, including Iran (Moreno et al. 2000, Jamali & Banihashemi 2012, 2013). Picoa species form symbiosis mainly on roots of annual and perennial herbaceous plants of the Helianthemum, including H. ledifolium and H. salicifolium var. salicifolium (Jamali & Banihashemi 2012, 2013), H. nummularium (Riousset et al. 1989, 1996), H. sessiliflorum (Sbissi et al. 2010), H. squamatum and H. kahiricum (Moreno et al. 2000). In Iran, mycorrhizal association between sedge and desert truffles is little known. Ammarellou et al. (2007) isolated the sedge roots (Kobresia bellardii) directly from under zone of Terfezia boudieri. During 2013–14, roots of Carex stenophylla Wahlenb were collected from various rangeland sites in Iran. The field and anatomical studies showed that, C. stenophylla have ectomycorrhizal associations with P. lefebvrei in the studied areas. In general, external mycelium was observed around all the mycorrhizal plants. The ITS1-5.8S-ITS2 gene region was amplified with the genomic DNA extracted from roots by nested polymerase chain reaction using the universal fungal primer pair ITS1/ITS4 and specific primer pair FLE (5´GTA CCT TAC CTG TTG CTT CCG TG) and RLE (5´ATC CCT ACC TGA GCC GAG GTC AA) which were designed based on ITS1-5.8S-ITS2 gene region of Picoa lefebvrei. Nested PCR of ITS1/ITS4 amplified product with FLE/RLE primers resulted in amplification of 500 bp products in C. stenophylla roots. Sequences of PCR products amplified by FLE/RLE in two randomly root samples were similar (100%) with previously published DNA sequences of P. lefebvrei specimens and confirmed the existence of P. lefebvrei in mycorrhizal roots of C. stenophylla in the rangelands of Iran. Moreover, nested PCR increased the sensitivity of FLE/RLE primers to 10 fg DNA concentration.
سال انتشار :
1394
عنوان نشريه :
رستنيها
عنوان نشريه :
رستنيها
اطلاعات موجودي :
دوفصلنامه با شماره پیاپی 50 سال 1394
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
لينک به اين مدرک :
بازگشت