ارتباط بين حد آستانه اي و اندازه موتيف نشانگرهاي ريزماهواره با صفات رشد و شاخص نسبت كليبر دربزهاي تجاري

Association between threshold size and motif length of microsatellite markers with growth traits and Keliber ratio in commercial goats

تعيين ژنوتيپ جايگاه هاي ريزماهواره اي هميشه با ريسك بروز خطا همراه است، كه مي تواند به طور معني داري كليه نتايج حاصل از آنرا تحت تاثير قرار دهد. يكي از راهكارهاي جديد براي حل اين مشكل، استفاده از سامانه گروه بندي جديد ژنوتيپي براساس ماهيت توالي موتيف و دامنه آللهاي مشاهده شده به جاي قرايت ژنوتيپ انفرادي هر جايگاه مي باشد. در اين راستا، هدف از مطالعه حاضر ارزيابي ارتباط بين سه گروه بندي جديد ژنوتيپي هموزيگوت براي آلل هاي كوتاه، هموزيگوت براي آلل هاي بلند و هتروزيگوت براي تركيب آلل هاي كوتاه و بلند براي تعدا كل 13 جايگاه ريزماهواره با صفات رشد و شاخص نسبت كليبر در بزهاي تجاري بوير بود. پس از تصحيح اثرات ثابت، نتايج مطالعه حاضر نشان داد كه گروه ژنوتيپي هتروزيگوت در جايگاههاي TEXAN006 وCSSM32 تاثير معني داري بر روي صفت وزن تولد بزغاله ها دارند (P < 0.05). همچنين افراد متعلق به گروه هموزيگوت براي آلل هاي بلند در جايگاه BMC1009 به طور معني دار داراي وزن از شيرگيري بالاتري در مقايسه با ديگر گروه هاي ژنوتيپي بودند (P < 0.05). علاوه بر اين ارتباط معني داري درجايگاه هاي ريزماهواره اي BM4307، BM4621 و UWCA46 با صفت افزايش وزن روزانه مشاهده گرديد (P < 0.05). در مجموع نتايج مطالعه حاضر نشان داد، كه ديدگاه گروه بندي جديد آللهاي مشاهده شده در جايگاه ريزماهواره بر مبناي تغيير طول موتيف مي تواند خطاهاي تعيين ژنوتيپ ناشي از وجود باندهاي كاذب در سيستم تعيين ژنوتيپ انفرادي را حداقل نمايد و شانس بالاتري را براي مشاهده همبستگي بين اين جايگاهها و صفات اقتصادي مورد ارزيابي ايجاد كند.

Microsatellite genotyping can always be prone to genotyping errors which significantly affect the entire subsequent analysis. One of the new approaches to overcome this problem is an alternative method of using a clustering system of genotypes based on microsatellite motif length and allelic frequencies range instead of individual genotypes. The objective of the present study was to establish an association of 13 microsatellite markers, classified into three new groups based on allele size consisting homozygous for the short allele, homozygous for the long allele and the class of heterozygous for long and short alleles, with body weight and Keliber ratio in commercial Boer goats. The results after considering the fixed effects, revealed that the class of heterozygous for long and short alleles of TEXAN006 and CSSM32 loci were significantly associated with kids birth weight (P < 0.05). The highest weaning weight was observed in individuals homozygous for long alleles at the BMC1009 locus (P < 0.05). The BM4307, BM4621 and UWCA46 loci were also shown an association with average daily gain (P < 0.05). In conclusion, the results showed that the use of motif length in the genotyping of microsatellite markers instead of genotype of each locus can minimize the genotyping errors and cause the higher probability to get a significant association with economically important traits.