بررسي ساختار ژنتيكي جمعيت شاه ميگوي آب شيرين (Astacus leptodactylus) مناطق مختلف با استفاده از رديف يابي منطقه كنترل DNA ميتوكندريايي

در مطالعه حاضر ساختار ژنتيك جمعيت شاه ميگوي آب شيرين (Astacus leptodactylus) ، با استفاده از ناحيه كنترلي ميتوكندريايي (D-loop) و روش توالي يابي DNA مورد بررسي قرار گرفت. به همين منظور تعداد 132 نمونه شاه ميگو از مناطق مختلف درياي خزر و درياچه سد ارس در سال 1390جمع آوري گرديد. سپس كميت DNAنمونه ها به روش اسپكتروفتومتري و كيفيت آن از طريق الكتروفورز ژل آگارز و رنگ آميزي با اتيديوم برومايد تعيين شد. در مجموع در نمونه هاي مناطق مختلف، 38 هاپلوتيپ شناسايي و تنوع هاپلوتيپي و نوكليوتيدي به ترتيب برابر با 049/0 ± 811/0 و 0038/0 ± 0127/0 اندازه گيري شد. مقدار D در آزمون بي طرفي تاجيما 120/3 و ميانگين آزمون مربع كاي 25/78 = ?2 نيز بدست آمد. مقدار D بدست آمده در بين نمونه ها ممكن است نشان دهنده متعادل بودن فشار انتخاب باشد. از طرف ديگر، نتايج منفي آزمون گسترش و پراكنش تاريخي جمعيت ها (Fuʹs Fs ) و همچنين شاخص هارپندينگ تاييد كننده گسترش جمعيت ها بود. با توجه به نتايج آزمون هاي تمايز FST، آزمون دقيق و آناليز واريانس مولكولي مناطق آستارا در درياي خزر، رودخانه سياه درويشان و جفرود اختلاف معني داري را با ساير مناطق نشان دادند ( 001/0 P < ). همچنين مشخص گرديد كه در مناطق نمونه برداري،گروه هاي متمايزي از شاه ميگوي آب شيرين وجود دارد، بطوري كه نمونه هاي رودخانه سياه درويشان و جفرود و ناحيه آستارا گروه هاي متمايز ژنتيكي از اين گونه را نشان مي دهند. بطور كلي يافته هاي اين تحقيق مي تواند نقش موثري براي شناسايي ذخاير و بهبود ژنتيكي شاه ميگوي آب شيرين ايفا نمايد.

In this study population genetic structure of freshwater crayfish (Astacus leptodactylus) in Iran was investigated using direct sequencing of mtDNA control region. A total of 132 samples were collected from the different locations. The quality and quantity of total DNA were determined by agarose gel electrophoresis ethidium bromide staining and spectrophotometery, respectively. The results showed that 38 haplotypes were observed between samples in sequencing analyses. The haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (?) were 0.811±0.049 and 0.0127±0.0038 sequencing techniques, respectively. Tajima’s D and chi-square (?2) values were 3.120 and 78.25, respectively. The significant positive D value for the samples might suggest balancing selection. Significantly negative Fuʹs Fs values and significantly positive Harpending test values were taken as evidence of a population expansion.The results of FST ,Exact test and analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that samples between Siahdarvishan River , Jafrood River and Astara region in the southwest Caspian sea statistically are significant in sequencing techniques (P < 0.0001).Therefore three distinct groups were identified. These results showed that haplotype distributions in different locations were significant and populations of Siahdarvishan River and Astara region statistically were significant (P < 0.0001). These results suggests that the unique genetic structure of Siahdarvishan River, Jafrood River and Astara region represent a highly valuable genetic resource and provide useful information for identifying populations and genetic improvemnet.