شناسايي و بررسي برخي از ويژگي هاي ويروس آلوده كنندة زعفران ( Crocus sativus ) در ايران

Identification and partial characterization of the virus infecting saffron (Crocus sativus) in Iran

پس از نمونه برداري تصادفي از برگها و بنه هاي گياه زعفران (.Crocus sativus L) از شش استان كشور در سال هاي 1390 تا 1394، شمار 641 از 890 نمونه با آنتي بادي هاي عمومي جنس پوتي ويروس و همان طور با آنتي بادي اختصاصي ويروس موزاييك معمولي لوبيا (BCMV) در آزمون الايزا واكنش مثبت نشان داد. وزن مولكولي پروتئين پوششي (CP) چند جدايه مورد بررسي پوتي ويروس زعفران با استفاده از آزمون وسترن بلات 35 كيلو دالتون محاسبه شد. پس از استخراج آر. آن. ا كل از گياهان آلوده، سه قطعه منقطع از ژنوم (مربوط به انتهاي 3 زنوم و بخشي از نواحي CI و HC-Pro تكثير شد. پروتئين پوششي (CP) پوتي ويروس زعفران بر پايه توالي نوكلئوتيدي بيشترين يكساني را (74 درصد) با Ceratobium mosaic virus و Telosma mosaic virus و بر پايه توالي ترجمه اسيد آمينه اي بيشترين يكساني را (78/8 درصد) با Beam common mosaic necrosis virus داشت. به رغم رابطه سرم شناختي (سرولوژيكي) بالاي اين پوتي ويروس با BCMV و خويشاوندي تبارزايي (فيلوژنتيكي) با زير گروه BCMV بر پاية ناحية CP، ميزان يكساني توالي نوكلئوتيدي و ترجمه اسيد آمينه اي پروتئين پوششي آن كمتر از آستانه تعيين حدود و گستره گونه در جنس پوتي ويروس است. لذا به احتمال زياد پوتي ويروس آلوده كننده زعفران گونه جديدي از جنس پوتي ويروس بوده كه اظهارنظر قطعي مستلزم تعيين توالي كل ژنوم آن است.

Following the random sampling of saffron (Crocus sativus L.) leaves and corms from six provinces of Iran, during growing seasons of 2011-2015, a total of 890 leaf tissue samples were investigated by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) tests. The results revealed that 641 samples showed positive reaction only with Potyvirus genus specific and exactly with Bean common mosaic virus (BCMV) specific antibodies. The molecular mass of several isolates of the virus coat protein (CP) was estimated as 35 kDa by western blotting. Following total RNA extraction from virus infected samples, three discontinuous fragments (corresponding to genomic 3', partial CI and HC-Pro regions) were amplified. The CP region of the virus infecting saffron has the highest nucleotide identity with Ceratobium mosaic virus (CerMV) and Telosma mosaic virus (TelMV) (74%) and the highest deduced amino acid identity with Bean common mosaic necrosis virus (BCMNV) (78.8%). Despite the high serological relationship with BCMV and a close phylogenetic relationship with BCMV subgroup based on CP region, the identity values are less than described species demarcation criteria for Potyviridae family. Overall, it seems that the saffron infecting Potyvirus is a new species of Potyvirus genus but the definitive statement requires sequencing the entire genome of the virus.