مطالعه تنوع ژنتيكي جدايه هاي Septoria tritici از مزارع گندم استان ايلام با استفاده از نشانگر SSR

Study of genetic diversity of Septoria tritici isolates from wheat fields in Ilam province using SSR marker

سپتوريوز برگ گندم (Septoria tritici blotch (STB يكي از مهمترين بيماري هاي گندم در استان ايلام مي باشد. براي تعيين تنوع ژنتيكي بيمارگر در مزارع گندم استان ايلام تعداد 44 نمونه آلوده از مزارع مناطق مختلف جمع آوري گرديد. پس از كشت، خالص سازي و شناسايي جدايه ها، آزمون مولكولي با استفاده از پنج جفت آغازگر ريزماهواره انجام گرديد. از آغازگرهاي ريزماهواره 22 آلل در جدايه ها تكثير كردند. ميانگين تعداد آلل در هر جايگاه 4/4 مي باشد. تنوع ژنتيكي جمعيتها داراي دامنه 0/138 تا 0/166 و ميانگين 0/154 بودند. بر اساس دندروگرام در سطح تشابه 0/54 درصد، جدايه ها در 18 گروه قرار گرفتند. نتايج تجزيه واريانس مولكولي نشان داد كه 98 درصد از تنوع ژنتيكي در بين كليه جدايه ها و تنها 2 درصد آن به مناطق مختلف جغرافيايي اختصاص دارد. بنابراين بين جدايه ها از مناطق مختلف شباهت ژنتيكي بالايي وجود داشت. شباهت ژنتيكي بالا را مي توان به مهاجرت ژن يا ژنوتيپ در اثر عوامل مختلف نسبت داد.

Septoria tritici blotch (STB) caused by Septoria tritici is one of the most important wheat diseases in Ilam Province. In order to determine genetic diversity of pathogen, 44 samples were collected from wheat fields of different regions in Ilam province. Molecular test was carried out with a set of five pairs of SSR primers after purification and identification of isolates. The SSR primers amplified a total 22 alleles among isolates. The average of allele number was 4.4 per each primer. Genetic diversity of the populations ranged from 0.138 to 0.166 with an average of 0.154. Cluster analysis based on UPGMA method and Dice coefficient, divided the isolates into 18 groups at 0.54% similarity level. Result of AMOVA showed that 98% of genetic diversity was within populations and only 2% was between populations from different geographical regions. Therefore there is the high genetic similarity between isolates from different regions. High genetic similarity can be attributed to emigration of gene or genotype as a result of various factors.