بررسي خاصيت آنتاگونيستي و تنوع ژنتيكي جدايه هاي استرپتومايسس استخراج شده از خاكهاي استان كرمان جهت كنترل بيولوژيك قارچ بيمارگر Sclerotinia sclerotiorum

Evaluation of antagonistic effect and genetic diversity of Streptomyces strains isolated from soils of the kerman province as biological control of Sclerotinia sclerotiorum

در تحقيق حاضر براي تعيين جدايه هاي مناسب استرپتومايسس، اثرات آنتاگونيستي 30 جدايه استخراج شده از خاكهاي استان كرمان عليه قارچ بيمارگر Sclerotinia sclerotiorum مورد بررسي قرار گرفت. از مجموع اين جدايه ها ، 10 جدايه استرپتومايسس در روش Dual Culture از خود خاصيت آنتاگونيستي نشان دادند كه بيشترين آن به استرپتومايسس جدايهUK 363 مربوط بوده است. آنگاه به منظور بررسي رابطه فيلوژني و تنوع ژنتيكي 30 جدايه مذكور، استخراج DNA از آنها به روش CTAB صورت گرفت و از 10 آغازگر RAPD جهت انجام PCR استفاده شد. پس از انجام الكتروفورز 128 باند قوي و واضح در محدوده bp250 تا bp2800 تشخيص داده شد. اطلاعات بدست آمده توسط نرم افزار NTSYS و به روش UPGMA با ضريب تشابه دايس آناليز شدند. درختچه بدست آمده، 30 جدايه استرپتومايسس را در خط برش 58% ، در دو گروه كلي قرار داد. در گروه اول 10 جدايه داراي خاصيت آنتاگونيستي و در گروه دوم 20 جدايه فاقد خاصيت قرار گرفتند. گروه بندي جدايه ها با استفاده از روش تجزيه به مولفه هاي اصلي نيز انجام شد و پلات هاي دو بعدي و سه بعدي مربوطه رسم گرديد و جدايه ها به هشت گروه مختلف تقسيم شدند.

At the present research, 30 isolates of Actinomycetes have been isolated from agricultural soils of Kerman Province of Iran and assayed for antagonistic activity against Sclerotinia sclerotiorum. 10 isolates showed antagonistic effect of In Disc-Agar method, Among selected isolates, Streptomyces isolate 363 UK showed high antagonistic activity. Also, in order to determine genetic diversity of 30 isolates of Streptomyces, the DNA was extracted using CTAB method in laboratory. To do molecular investigation 10 RAPD primers were used for PCR. After doing electrophoresis, 128 sharp bands between 250 and 2800 base pair were recognized. The experiment results were analyzed using NTSYS software and UPGMA method with Dice coefficient. The analyzed cluster found from Dice coefficient divided the 30 Streptomyces isolates in two major groups. In the first group, 10 isolates were antagonistic properties,and in the second group of 20 isolates were no antagonistic effect. Grouping isolates using principal components analysis was performed and twodimensional and three-dimensional plots respective was drawn. The isolates were divided into eight groups.